Прикладная геномика

Магистратура

Мы поднимем твой уровень программирования и научим решать прикладные задачи в области геномики!

Лучше всего программа подойдёт студентам с естественно-научной подготовкой, которые хотят получить навыки анализа данных, программирования и машинного обучения, и применить их к реальным биологическим задачам. Каждый студент сможет поработать над реальными проектами от индустриальных и научных партнеров программы.
Спектр возможных областей очень широк — от геномики человека до метагеномики морских беспозвоночных, от медицины до биотехнологии.

Мы ищем студентов
с естественнонаучным бэкграундом, программистов и аналитиков данных!

Обучение проходит в аудиториях и лабораториях Университета ИТМО
в центре Санкт-Петербурга. Занятия проходят на русском языке, но хороший английский тебе пригодится - придётся читать очень много современных статей и общаться с коллегами,
в том числе и из других стран.

Пары проходят очно, но есть возможность подключаться удалённо. Программа в целом сочетается с неполной занятостью и удалённой работой, а вот тем, кто работает на фулл-тайм, придётся непросто. Мы будем выкладывать записи занятий, но живое общение
с преподавателем и однокурсниками делает обучение в разы эффективнее, проверено.

Всё обучение построено на практических задачах. С самого начала можно будет включиться в работу над реальными проектами под руководством ученых мирового уровня.

В программе есть обязательная часть и дисциплины по выбору.
И этот выбор в ИТМО огромен — ты можешь брать курсы с разных факультетов и составлять свой собственный учебный план.

В ИТМО у тебя будет возможность выбрать подходящий вид
выпускной работы — классическая магистерская диссертация,
научная статья или бизнес-проект.

Выпускники программы обладают профильными биологическими знаниями, навыками анализа данных и управления проектами.

Вы сможете:

научную карьеру и работать над проектами в аспирантуре ведущих российских и зарубежных университетов

путь биоинформатика-инженера, который решает прикладные и теоретические задачи в биотехнологических и биомедицинских компаниях

карьеру в менеджменте биотехнологических продуктов

свой собственный проект и выводить его на рынок

Мы готовим универсальных специалистов в области биоинформатики, способных влиться в ведущие российские биотехнологические компании или развивать самостоятельную научную карьеру. В течение обучения студенты
“Прикладной геномики” будут работать на реальных проектах

Национальная инициатива «100 000+Я»

Роснефть совместно с Биотек Кампус организовали проект по секвенированию 100000 геномов россиян. Участие в этом проекте открывает возможности для проведения крупномасштабных исследований генетических заболеваний и разработки методов их лечения. В ходе работы предстоит анализировать различные генетические варианты и их распространение в разных популяциях на территории РФ.
 

Платиновый геном

Для хороших популяционных исследований очень важен надежный референс, близкий к исследуемой популяции. В рамках этого проекта планируется создание золотого стандарта мутаций и структурных перестроек на базе одного генома, глубоко отсеквенированного различными методами.

Арктические геномы

Этот проект посвящен исследованию геномов организмов, обитающих в Российской Арктике.
Участие в нем представляет уникальную возможность изучить генетическое разнообразие
арктической фауны и флоры.

Геномная сборка немодельных организмов

Среди наших проектов академического трека есть проекты по геномной сборке интересных организмов.
У каждого из них есть свои особенности структуры генома и свои проблемы при сборке - например,
в геноме морского огурца мы столкнулись с тем, что два гаплотипа совершенно не похожи друг на друга, соответственно сборка оказалась дуплицирована, что затрудняло последующий анализ.
А при сборке холодоустойчивой пиявки столкнулись с невероятной бактериальной контаминацией.

Создание геномного паспорта

В рамках этого проекта студенты реализовывают воспроизводимый пайплайн для сборки, аннотации, сравнительной геномики бактериальных штаммов для нужд российской индустрии.
Очень важно, чтобы штамм, который используют для произведения заквасок для йогуртов, полностью совпадал с референсным штаммов и не приобретал свойств, которые представляют для людей потенциальную опасность.

Выбери подходящий!

Конкурс «Портфолио» Университета ИТМО

Если у вас есть научно-исследовательские, инженерные или междисциплинарные достижения, вы можете поступить в ИТМО без сдачи вступительного экзамена. Портфолио состоит из трех разделов: мотивационное письмо, резюме и достижения. В зависимости от специфики программы, в CV нужно добавить публикации, выступления на конференциях, сертификаты, дипломы и т. д. Каждое достижение имеет свой балл. Победителем становится конкурсант, набравший более 85 баллов

Конкурс докладов «Конгресс молодых ученых» (победитель)

Участие в конкурсе докладов, в рамках Конгресса молодых ученых ИТМО, дает возможность поступить в магистратуру ИТМО без экзаменов. Выберите направление соответствующее тематике программы магистратуры, подготовьте доклад и защитите его на Конгрессе. Подать заявку можно только на одну образовательную программу магистратуры.

МегаОлимпиада ИТМО

Если вы победитель или призер Мегаолимпиады ИТМО, найдите свое направление на сайте олимпиады и посмотрите список программ, на которые можно поступить без экзаменов. Этим правом можно воспользоваться в календарный год проведения Олимпиады или в календарный год, следующий за годом ее проведения. Поступить на следующий год можно только по программам, указанным в правилах приема года поступления.

Конкурс SCAMT Workshop Week

Создай практический научный проект в области химии, биологии, программирования за одну неделю. Конкурс впервые пройдёт в формате 3-в-1 и будет включать три проектных трека: цифровой, экспериментальный и индустриальный. За 1 неделю вы подготовите научный проект, узнаете о перспективных направлениях нанотехнологий, улучшите софты и познакомитесь с людьми со всей России!

Медалист/победитель "Я-профессионал"

Поступить без экзаменов могут победители и медалисты олимпиады. Укажите свой результат и название направления олимпиады в Личном кабинете абитуриента. Решение о зачете результата олимпиады «Я — профессионал» в качестве вступительного испытания, принимает руководитель программы.

Вступительный экзамен

Экзамен проводится дистанционно. Вы получите билет с двумя вопросами, на подготовку которых дается 45 минут, после чего защитите его перед приемной комиссией. Скачать вопросы для поступления и узнать даты проведения вступительных испытаний можно на странице с описанием программы. Чтобы получить допуск к экзамену необходимо заполнить Личный кабинет абитуриента и загрузить копию диплома.

Рекомендательное письмо от руководителя программы

Если вы вели работу с сотрудниками ИТМО, то руководитель программы магистратуры может составить письмо, в котором указывает общую характеристику способностей студента, сферу научных интересов и склонность к научной работе. Большое внимание уделяется достижениям за время учебы: выступлениям на конференциях, научным публикациям, участию в научных проектах, конкурсам, олимпиадам.

Перезачет итогов государственной аттестации

При перезачете учитывается средний балл приложения к диплому (не менее 4,3), тема выпускной работы и оценка за ГИА. В государственную итоговую аттестацию (ГИА) входят — защита ВКР и/или сдача государственного экзамена. По ПИГА можно поступить на то же самое или смежное направление подготовки. Решение о перезачете принимает экзаменационная комиссия магистерской программы.

Bioinformatics bootcamp 2024

Хакатон по прикладной геномике, где за 4 дня участники погрузятся в мир анализа данных NGS. Проводим с 24 по 27 июня в формате онлайн и оффлайн в Университете ИТМО. Регистрируйтесь до 19 июня включительно и поступайте в магистратуру без экзаменов!