Мы готовим универсальных специалистов в области биоинформатики, способных влиться в ведущие российские биотехнологические компании или развивать самостоятельную научную карьеру. В течение обучения студенты
«Прикладной геномики» будут работать на реальных проектах. Вот некоторые из них:
Национальная инициатива «100 000+Я»
В рамках сотрудничества с компанией «Роснефть» и «Биотек Кампус» реализуется масштабный проект по секвенированию 100 000 геномов россиян. Этот проект открывает двери для крупномасштабных исследований генетических заболеваний и разработки инновационных методов их лечения. Участники проекта будут анализировать генетические варианты и их распространение в различных популяциях на территории России, что позволит лучше понять генетическое разнообразие и его влияние на здоровье населения.
Для успешных популяционных исследований необходим надежный референсный геном, максимально близкий к изучаемой популяции. В рамках этого проекта совместно с «Биотек Кампус» создается «золотой стандарт» мутаций и структурных перестроек на основе глубокого секвенирования одного генома с использованием различных методов. Это позволит значительно повысить точность и достоверность генетических исследований.
Анализ метагеномов полости рта
Совместно с компанией «Генотек» мы проводим метагеномное секвенирование для изучения бактериального состава полости рта. Анализ этих данных в сочетании с анкетированием пациентов позволяет выявить интересные закономерности: устойчивость микроорганизмов, их связь с диетой, причины неприятного запаха изо рта, а также риски развития кариеса и пародонтоза.
Анализ STR (коротких тандемных повторов)
Короткие тандемные повторы (STR) играют ключевую роль в геноме человека: они используются для идентификации личности, а также связаны с более чем 20 наследственными заболеваниями. Точное определение STR из коротких ридов остается сложной задачей, и в рамках этого проекта мы работаем над ее решением совместно с компанией «Генотек».
Геномы немодельных организмов
Совместно с Институтом цитологии РАН мы изучаем геномы уникальных организмов, таких как динофлагелляты, амёбы, микроспоридии и тихоходки. В рамках проекта проводятся геномные, метагеномные и транскриптомные исследования, направленные на изучение коэволюции внутриклеточных паразитов и их хозяев.